Un dito è un dito di zinco-proteine a forma di volte che è formata da specifici amminoacidi nella proteina legante di uno ione zinco. Dito di zinco proteine spesso si legano al DNA e RNA, perché la loro forma consente una stretta interazione del dominio con i nucleotidi del DNA e dell'RNA. Le loro proprietà leganti nucleotidi consentono loro di funzionare nella regolazione dell'espressione genica e in assemblea virus.

Ci sono diversi tipi di strutture dito di zinco, ma la versione più comune consiste di un alfa-elica e un foglio di beta, i due più comuni strutture secondarie nelle proteine, su entrambi i lati di almeno uno ione zinco. L'elica alfa e beta sono stato tenuto in posizione da residui di cistina e istidina, che coordina le ioni di zinco tramite i loro atomi di azoto e di zolfo. Il dito di zinco si lega al DNA, e attraverso l'interazione di aminoacidi alla periferia del dito di zinco con coppie di basi al centro della doppia elica del DNA. Si tratta di un dominio compatto di proteine, e le sue piccole dimensioni permette di avere stretto contatto con coppie di basi del DNA.

proteine dito di zinco sono i fattori più comuni di trascrizione negli organismi viventi. Un fattore di trascrizione è una proteina che si lega al DNA e controlla il trasferimento di informazioni genetiche di RNA. La capacità delle proteine a dito di zinco target DNA li ha resi i candidati per la re-engineering mirato al fine di indirizzare le sequenze di DNA di interesse.

Ad esempio, un Zinc Finger Nucleasi (ZFN) è una proteina sintetica che ha un dito di zinco di ingegneria di dominio vincolante fuso ad una endonucleasi di restrizione, o DNA-attaccamento enzima. Il ZFN può essere usato per tagliare il DNA in punti specifici, ed è un utile strumento per promuovere il sito-specifica ricombinazione del DNA. Engineered dita di zinco può essere utilizzato anche come fattori di trascrizione artificiale.

domini dito di zinco sono presenti in alcune proteine virali, tra cui la neocapsid (NC) di proteine del dell'immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) virus. NC è un obiettivo attraente antivirali, perché è importante per l'assemblaggio virale ed è altamente conservata. Inibitori che colpiscono specificamente le dita di zinco delle proteine virali e retrovirali potrebbero essere utilizzati per prevenire la replicazione del virus. Ottenere composti antivirali di questa natura è un'area attiva di ricerca biomedica.

proteine dito di zinco svolgono un ruolo importante nel metabolismo delle cellule normali. Per essere efficace, composti anti-retrovirali devono specificamente bersaglio le proteine retrovirali dito di zinco. Queste proteine retrovirali sono distinte sequenze di amminoacidi e le differenze strutturali delle proteine cellulari dito di zinco, in modo da ottenere gli inibitori selettivi è un obiettivo raggiungibile.