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Che cosa è una macchia del Nord?

  

ibridazione Northern blot è una tecnica che viene utilizzata per rilevare l'RNA messaggero (mRNA) i livelli in un campione, e di quantificare la quantità di mRNA che è presente. Anche se altre tecniche più potenti esistono, Northern blot rimane lo standard per la sua semplicità e facilità d'uso. La tecnica del nord blotting permette anche per il confronto diretto di campioni multipli in un singolo esperimento.

L'RNA messaggero è un tipo di acido nucleico che si produce quando un gene viene espresso. Un gene che è acceso e funzionale all'interno di una cellula è trascritto in mRNA. L'mRNA viene poi trasportata nel citoplasma della cellula, dove si è tradotto in una proteina. Northern blot analisi di un campione di mRNA cellulare può quindi fornire informazioni utili circa la matrice di proteine della cellula sta producendo.

In una macchia a nord, l'mRNA viene estratto dalle cellule ed eseguire attraverso una denaturazione elettroforesi del gel, che permette di mRNA nel campione di essere separati in base alle dimensioni. I campioni di molecole di mRNA di dimensioni note si eseguono allo stesso tempo per fornire un controllo. Una volta che l'elettroforesi è completa, i campioni sono trasferiti e immobilizzato su una membrana solida, di solito di un materiale come il nylon. I campioni sono quindi esposti alle sonde marcata per diverse ore prima dell'analisi. Durante l'analisi, mRNA che ha ibridato a una sonda radioattiva può essere chiaramente individuati utilizzando x-ray.

Il nord tecnica permette blotting per l'osservazione dei modelli di espressione genica tra i diversi tipi di tessuti. RNA messaggero estratto da cellule di vari tessuti e tipi di organi può essere paragonato, e le risposte cellulari allo stress, infezioni, e molti altri stimoli e possono essere esaminate. Guardando le differenze di espressione di mRNA in condizioni differenti, uno scienziato in grado di stabilire quali tipi di proteine di una cellula produce in risposta a certi stimoli. Ciò può fornire indizi sulle funzioni delle proteine sconosciute, o, nel caso di proteine note, informazioni sulle risposte cellulari agli stimoli in questione.

Ad esempio, una macchia settentrionale possono dimostrare che l'espressione di un aumento di proteine sconosciute in risposta alla presenza di una tossina specifica. Si potrebbe allora essere teorizzato che la proteina è coinvolta nel ridurre la tossicità, forse per il trasporto della sostanza chimica fuori dalla cella o convertirlo in un metabolita. Se noto proteine sono in esame, che documenta i cambiamenti di espressione della proteina in grado di fornire informazioni circa la risposta stessa. Se l'espressione di un trasportatore noto molecolare è stato aumentato, per esempio, potrebbe essere confermato che la risposta cellulare alla tossina è per il trasporto della tossina fuori dalla cella.

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