Ci sono due raggruppamenti principali di bilaterian (simmetria bilaterale) animali: protostomes e deuterostomes. Sono anche chiamati superphyla, perché ogni contiene phyla animali più. Il deuterostomes tendono ad essere più complesse, e comprendono echinodermi, hemichordates, cordati (tutti i vertebrati), e un paio phyla minori. Il protostomes contiene praticamente tutto il resto, compresi gli artropodi, anellidi, vermi, molluschi, ecc phyla alcuni piccoli non sono classificati come. La differenza principale tra i due gruppi è come si sviluppano gli embrioni: in protostomes, la prima apertura in embrione diventa la bocca, e in deuterostomes, diventa l'ano.

maggior parte degli scienziati riconoscono almeno tre superphyla entro protostomes-Lophotrochozoa, Edcysozoa, e Platyzoa. Questi superphyla sono state proposte nel 1995, 1997 e 1998, rispettivamente, sulla base di prove molecolari e morfologiche. Lophotrochozoans ( "cresta-che porta gli animali") sono uniti dalla presenza di un lophophore, un anello di tentacoli ciliato attorno al loro bocca, utilizzato per afferrare particelle di cibo. Lophotrochozoans, a volte chiamato anche trochozoans, comprende circa una dozzina di phyla: Entoprocta, Mollusca, Annelida, Phoronida, Brachiopoda, Nemertea, Chaetognatha, Bryozoa, Myzostomida, Acoela, e Gnathostomulida. La maggior parte dei lophotrochozoans sono marine, che ha un senso, perché la bocca ciliato-tentacoli per afferrare gli alimenti sono più utili subacquea.

Oltre lophotrochozoans, un altro superphyla prevalentemente marino protostomes sono i platyzoans ( "animali da appartamento"), che platelminti e comprende una serie di importanti microscopiche, planctonici animali come rotiferi e gastrotrichs. Platyzoans si distinguono per l'assenza di un Celoma (cavità del corpo) o di una diminuita Celoma chiamato pseudocoel. In media, Platyzoa è il più semplice dei superphyla protostomi, anche se gli organismi semplici si trovano anche tra lophotrochozoans. Platyzoans erano precedentemente considerati membri di Lophotrochozoa, ma la maggioranza degli scienziati ora dare loro il proprio gruppo.

L'ultimo superphyla protostomi sono le Ecdysozoa, caratterizzato da muta dell'esoscheletro (Ecdysis). Ecdysozoa è il maggior successo e diffusione della superphyla protostomi, e comprendono artropodi (crostacei, insetti, chelicerates, e Miriapodi), nematodi (ascaridi), tardigradi, vermi di velluto, e diversi phyla minori. Nematodi sono uno degli animali più numerosi sulla terra, si trovano in tutti gli ambienti possibili e immaginabili, compresa l'Antartide, mentre artropodi contenere le specie più, probabilmente, oltre 7 milioni di euro, che rappresentano oltre il 90% di tutte le biodiversità animale sulla Terra. Anche se ci sono numerosi altri organismi che utilizzano una qualche forma di conchiglia o cuticola esterna, il Ecdysozoa sono ovviamente le più efficaci evolutivo.