La differenza tra la nanotecnologia molecolare e delle nanotecnologie (MNT) è che il primo è usato per riferirsi a una scienza che si occupa di particelle su scala nanometrica di 1-100 nanometri, mentre il secondo si riferisce specificamente alle teorie di macchine su scala nanometrica in grado di costruire prodotti dal atomo up, chiamato anche di fabbricazione molecolare (MM).

Un nanometro, o un milionesimo di millimetro, è una misura estremamente piccola di lunghezza a circa 5-7 atomi in termini di dimensioni. Il termine generale "nanotecnologie" si occupa di strutture che si misurano in nanometri. Un batterio in confronto è molto più grande. Fullereni e nanotubi di carbonio, tuttavia, come scoperto da Richard Smalley della Rice University, rientrano nella competenza delle nanotecnologie.

Il termine, non "nanotecnologia" è sempre stato usato in modo così ampio. E 'stato coniato da K. Eric Drexler nel suo libro 1986, Engines of Creation fare riferimento alle sue teorie per la produzione molecolare, seguito da dare alle idee visionarie presentato 27 anni prima dal fisico famoso, Richard Feynman. Come la possibilità di nanotecnologie molecolari è cresciuto e l'eccitazione costruita nella comunità scientifica, (una situazione che spesso porta ad eventuali sovvenzioni e altre forme di finanziamento), molti ricercatori ha iniziato ad usare il termine per i loro sforzi proprio su scala nanometrica, non collegati alla produzione molecolare.

Compounding possibile confusione nel settore pubblico, ci sono anche i potenziali benefici e rischi potenziali associati con entrambe le nanotecnologie e la fabbricazione molecolare, anche se diversi. Quindi, alla fine Drexler ha scelto di qualificare ulteriormente il settore della scienza, al fine di impostare lo distingue.

Un'altra differenza tra i due rami è che la nanotecnologia è una scienza stabilita nella misura in cui le nanoparticelle vengono già commercializzati in prodotti, anche se alcuni critici sostengono la ricerca sui possibili rischi delle nanoparticelle non ha tenuto il passo con il marketing.

nanotecnologia molecolare (MNT /MM), al contrario, è ancora teorica. Quando si rese conto, è pronta a portare con sé una nuova rivoluzione tecnologica. Nanomedicina, una sezione speciale del MNT, potrebbe anche estendere la durata della vita umana attraverso l'eliminazione della malattia. MNT ha anche potenziali pericoli e dei suoi vantaggi e gli svantaggi vengono ampiamente studiato.