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Che cosa è un sequenza di aminoacidi?

  

Una sequenza di aminoacidi è l'ordine che gli amminoacidi si uniscono a formare catene di peptidi o polipeptidi. Se la catena peptidica è una proteina, la sequenza di aminoacidi è spesso chiamata la struttura primaria della proteina. A causa della struttura di aminoacidi e di come si legano insieme, la sequenza degli aminoacidi viene letto solo in una direzione ed è specifica per il peptide in corso di formazione.

Ci sono oltre 100 diversi aminoacidi, con circa 20, che comunemente compongono le proteine. Tutti gli amminoacidi hanno una struttura generale che contiene uno di carbonio con un gruppo amminico, NH3, da un lato e un gruppo carbossilico, COOH, dall'altro. Il gruppo amminico è di base o ha una carica positiva, mentre il gruppo carbossilico è acida e porta una carica negativa. La maggior parte degli amminoacidi avere solo una di ciascun gruppo, che li rende neutrale in carica. Gli aminoacidi sono dissociati dal gruppo R che è collegato alla centrale di carbonio.

Il gruppo R di un amminoacido è una catena laterale che è specifico per ogni amminoacido, che può essere una varietà di sostanze chimiche diverse strutture. Al massimo di base, il gruppo R è sostituito da un atomo di idrogeno, che crea l'aminoacido glicina. Molte altre strutture chimiche più avanzate in grado di sostituire la R. In tirosina, una struttura ad anello è attaccato al carbonio al posto del gruppo R, e in lisina, esso è sostituito da una lunga catena di idrocarburi-una molecola costituita da un backbone di carbonio con atomi di idrogeno attaccati.

Per formare una sequenza di aminoacidi, la forma legami peptidici tra il gruppo amminico di un amminoacido e il gruppo carbossilico degli altri. Questo è un esempio di una reazione di condensazione di una molecola d'acqua si perde quando i due aminoacidi si uniscono. Per estendere la sequenza per creare un polipeptide, il nuovo acido amino è sempre aggiunto alla fine carbossile della catena peptidica che già esiste. Se una proteina si sta formando, centinaia e persino migliaia di amminoacidi sono uniti tra loro.

Le proteine si formano all'interno delle cellule durante il processo di traduzione. La sequenza degli aminoacidi necessari per ogni proteina è determinata dal DNA presenti nel nucleo. Durante la trascrizione, il gene in questione è trascritto per fare un filamento di RNA messaggero o mRNA. L'mRNA si sposta fuori dal nucleo e nel citoplasma delle cellule di un ribosoma, dove la traduzione avviene.

Gli atti di mRNA come un modello per il quale gli amminoacidi devono essere uniti. Per ogni amminoacido, esiste un codice specifico tripletta di nucleotidi. Sulla base di questo codice tripletta, RNA transfer o tRNA, trasporta aminoacidi liberi dal citoplasma al ribosoma dove si sono uniti alla catena esistente. Come l'mRNA è tradotto, gli amminoacidi sono uniti per formare la specifica sequenza di aminoacidi per le proteine.

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