Il sistema a tre dominio è un metodo per classificare la vita cellulare che è stata inizialmente proposta da Carl Woese nel 1990. Mentre il sistema a tre dominio incontrato qualche resistenza iniziale, da allora è diventata ampiamente accettato, grazie alle scoperte scientifiche che hanno sostenuto la proposta Woese's. Nel quadro del sistema di dominio, per tutta la vita cellulare può essere divisa in tre settori: Archaea, Bacteria, e Eukaryota, e ogni dominio può essere ulteriormente diviso in regni, phyla, classi, e così via.

L' sistema di classificazione distingue tra gli organismi eucarioti, organismi che hanno le cellule che includono un nucleo, e due tipi di organismi procarioti, organismi con cellule che mancano di un nucleo. Inizialmente, Archaea e batteri sono stati entrambi raggruppate come procarioti, anche se ogni gruppo aveva il suo regno. Woese sostenuto che Archaea e batteri sono stati distinti in modo che in realtà appartenevano a domini separati, non solo regni separati.

Le differenze tra Archaea e batteri principalmente avere a che fare con la genetica complessa. Quando Woese pubblicato la prima volta nella sua proposta, la ricerca genetica sembrava suggerire che i due regni erano discesi da un antenato comune, e che erano abbastanza simili che non richiedono domini separati. Come risultato, i tre-sistema di dominio è stata inizialmente accolta con scetticismo.

Tuttavia, ulteriori ricerche hanno indicato che Woese è stata effettivamente diritto, e che questi organismi erano così geneticamente distinte di cui avevano bisogno i propri domini. Archaea e batteri sono entrambi procarioti, ma le loro strutture cellulari sono molto diverse, e hanno ben distinti l'RNA ribosomiale, indicando che questi domini divergevano molto tempo fa, e sono in gran parte estranei. Il sistema a tre dominio per classificare gli organismi sembra essere più precisi rispetto ai sistemi precedenti, ora che le prove a sostegno è stato scoperto.

All'interno Archaea, vi è un solo regno, chiamato anche Archaea. Il dominio Bacteria ospita anche un solo regno, conosciuta come batteri. Eukaryota può essere diviso in quattro regni: animali, piante, funghi e protisti. All'interno di ogni dominio, c'è una grande diversità di vita, che vanno da extremophilic Archaea che prosperano in ambienti che avrebbe ucciso la vita maggior parte degli altri sulla Terra per fragili orchidee tropicali nel regno vegetale.

Questo sistema è particolarmente importante per le persone che studiano gli organismi procarioti, in quanto il sistema a tre dominio sottolinea la differenza tra Batteri e Archaea. In genere i ricercatori specializzati in uno o l'altro, con la ricerca genetica per saperne di più gli organismi che studiano. Alcune persone usano ancora il sistema a due impero, che divide la vita cellulare in Prokaryota e Eukaryota, e poi in rispettivi regni, ma questo sta diventando sempre più rara.