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Che cosa è un Transcriptome?

  

Il trascrittoma è una collezione completa di RNA da un organismo, un gruppo di celle, o anche una specifica cella. L'RNA è sintetizzato dal DNA attraverso un processo noto come trascrizione. Il presente RNA in una cellula e l'organismo determina quali geni sono espressi, e cambia nel corso della vita di un organismo, a differenza del DNA, che rimane statico. La pressione ambientale è una delle ragioni principali per le modifiche, in quanto il corpo cerca di adattarsi alle mutevoli situazioni ambientali per mantenere se stesso funzionamento.

Il trascrittoma è molto più piccolo genoma di un organismo, la collezione completa del DNA nell'organismo. Detto in termini semplici, si potrebbe pensare di DNA come un libro di cucina, che elenca una collezione completa di ricette che possono essere fatte. Il trascrittoma è il codice che determina quale le ricette saranno effettuate, e quando. Il libro di cucina rimane statico per tutta la vita, mentre le variazioni del trascrittoma in risposta a fattori ambientali.

Una parte importante del trascrittoma è molecole di mRNA. RNA messaggero è l'RNA che comunica con i ribosomi nelle cellule di dirigere le cellule a produrre le proteine diverse. Queste proteine sono utilizzati per una vasta gamma di funzioni. Altre parti di codice potrebbero non direttamente per la produzione di proteine, ma fare le cose come determinare la struttura delle cellule e regolazione dell'espressione genica. Insieme, le varie componenti del trascrittoma mantenere un buon funzionamento dell'organismo e determinare l'espressione genica all'interno di tale organismo.

In varie cellule del corpo, il trascrittoma può essere molto diverso. Cellule del fegato, per esempio, hanno RNA che li rende le cellule del fegato, e garantisce che le cellule svolgono funzioni necessarie. Cellule della pelle, d'altra parte, hanno un diverso trascrittoma che attiva i geni necessari per rendere una cella una cellula della pelle. Entrambe le cellule del fegato e la pelle hanno una copia completa del genoma, ma la loro transcriptomes determinare quali parti del genoma siano attivate.

Proprio come con il DNA, è possibile sequenza di RNA. Sequenziamento Transcriptome si può fare per saperne di più sulle azioni di una cellula e il DNA dell'organismo ospite, e di individuare i luoghi in cui l'espressione delle informazioni genetiche va storto. Quando una cellula del fegato diventa maligna, per esempio, è perché il trascrittoma non funziona come dovrebbe essere, e di geni di neoplasia si sono attivati, o le cellule mancanza del regolamento in qualche modo, causando loro di crescere fuori controllo. Sequenziamento del RNA in una cellula maligna può contribuire a una figura di ricercatore a quale gene è stato attivato o inattivato a causa della neoplasia.

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