Un punteggio LOD è una rappresentazione del rischio di un collegamento tra due tratti genetici. Se il punteggio LOD è alto, significa che i tratti sono strettamente collegati, e quindi di solito ereditato insieme. Punteggi bassi, d'altra parte, indicano una correlazione bassa. Comprensione punteggi LOD è importante per i genetisti per una serie di motivi, che vanno dal desiderio di comprendere le particolari condizioni genetiche di un desiderio di capire dove si trova un gene, utilizzando le informazioni sui geni conosciuti.

Per capire l'importanza del punteggio LOD, è utile sapere che i due più loci genici sono gli uni agli altri, tanto più è probabile che saranno ereditati insieme. Se i geni sono sui cromosomi diversi, per esempio, sono di solito ereditato separatamente, perché una grande quantità di crossover può verificarsi durante la meiosi. Se i geni sono sullo stesso cromosoma, ma distanti, ma sono anche spesso ereditate in maniera indipendente. Loci, quando sono in prossimità del cromosoma stesso, tuttavia, tendono ad essere ereditati insieme. Questa informazione è alla base del punteggio LOD.

LD sta per "logaritmo della probabilità", a riprova del fatto che il numero è espresso logaritmica. Come regola generale, se il punteggio LOD è di tre o superiore, significa che c'è un'alta probabilità di linkage genetico. I numeri più bassi indicano una minore probabilità di linkage genetico, anche se può ancora essere utile nel processo di eliminazione.

Per determinare un punteggio LOD, un campione di dati è necessaria. In questo tipo di analisi statistica, il più grande è il campione, il migliore. I ricercatori che lavorano con organismi come i moscerini della frutta può attivamente razza una popolazione di far emergere o sopprimere le caratteristiche desiderate al fine di studiare il punteggio LOD di tratti specifici, mentre con le popolazioni, come gli esseri umani, i ricercatori devono limitarsi ai dati raccolti attraverso l'osservazione. Campioni di grandi dimensioni tendono a produrre più informazioni statisticamente significative in quanto riducono il rischio di pinne e cluster che falsare i dati.

Utilizzo di dati da una popolazione di interesse, i ricercatori un'occhiata a quanto spesso i tratti di interesse si verificano insieme, e quanto spesso emergono separatamente. Queste informazioni vengono usate per arrivare alla frequenza di ricombinazione, guardando a come spesso caratteri genetici ricombinarsi. Di essere sullo stesso cromosoma, la frequenza di ricombinazione deve essere inferiore al 50%, e deve diminuire ancora di più per indicare che loci sono vicini gli uni agli altri. Essi analizzano queste informazioni per determinare in che modo è probabile che vi sia un legame genetico, e come è probabile che non ci sia un legame genetico. Il punteggio LOD è determinato dividendo la probabilità di collegamento con la probabilità di alcun legame. In genere, LOD punteggi sono calcolati per loci multipli.